O Club Náutico El Quillá é uma agremiação esportiva sediada na cidade de Santa Fe, província homônima na Argentina. Atualmente o clube disputa a Liga Santafesina de Futebol.
O Club Náutico El Quillá foi fundado em 23 de outubro de 1935 por um grupo de amigos que decidiram criar um clube de remo. Em 1945, o clube inaugurou sua sede social e, em 1947, começou a praticar futebol.
Na década de 1950, o Club Náutico El Quillá se destacou no futebol local, vencendo o campeonato da Liga Santafesina de Futebol por quatro vezes (1953, 1954, 1955 e 1956). Em 1957, o clube participou do Campeonato Argentino da Primeira Divisão, mas foi eliminado na primeira fase.
Na década de 1960, o Club Náutico El Quillá continuou a se destacar no futebol local, vencendo o campeonato da Liga Santafesina de Futebol por mais três vezes (1961, 1962 e 1963). Em 1964, o clube participou novamente do Campeonato Argentino da Primeira Divisão, mas foi eliminado na primeira fase.
Na década de 1970, o Club Náutico El Quillá não obteve grandes resultados no futebol local, mas conseguiu se manter na primeira divisão da Liga Santafesina de Futebol. Em 1979, o clube participou do Campeonato Argentino da Primeira Divisão B, mas foi eliminado na primeira fase.
Na década de 1980, o Club Náutico El Quillá voltou a se destacar no futebol local, vencendo o campeonato da Liga Santafesina de Futebol por mais duas vezes (1982 e 1983). Em 1984, o clube participou do Campeonato Argentino da Primeira Divisão B, mas foi eliminado na primeira fase.
Na década de 1990, o Club Náutico El Quillá continuou a se destacar no futebol local, vencendo o campeonato da Liga Santafesina de Futebol por mais duas vezes (1991 e 1992). Em 1993, o clube participou do Campeonato Argentino da Primeira Divisão B, mas foi eliminado na primeira fase.
Na década de 2000, o Club Náutico El Quillá não obteve grandes resultados no futebol local, mas conseguiu se manter na primeira divisão da Liga Santafesina de Futebol. Em 2009, o clube participou do Campeonato Argentino da Primeira Divisão B, mas foi eliminado na primeira fase.
Na década de 2010, o Club Náutico El Quillá voltou a se destacar no futebol local, vencendo o campeonato da Liga Santafesina de Futebol por mais duas vezes (2013 e 2014). Em 2015, o clube participou do Campeonato Argentino da Primeira Divisão B, mas foi eliminado na primeira fase.
O Club Náutico El Quillá é um dos clubes mais tradicionais da cidade de Santa Fe. O clube possui um grande número de torcedores e é considerado um dos principais representantes do futebol local.