O FC Flora Tallinn Sub19 é uma equipa de futebol estoniana com sede em Tallinn. É a equipa sub-19 do FC Flora Tallinn, um dos clubes de futebol mais bem sucedidos da Estónia.

A equipa foi fundada em 1997 e compete na Liga Sub-19 da Estónia, o campeonato de futebol juvenil mais alto do país. O FC Flora Tallinn Sub19 venceu o campeonato por cinco vezes, em 2000, 2001, 2002, 2004 e 2006.

A equipa também participou na Liga dos Campeões da UEFA Sub-19, a principal competição de clubes juvenis da Europa. O FC Flora Tallinn Sub19 participou pela primeira vez na competição em 2000, e desde então participou em mais quatro edições, em 2001, 2002, 2004 e 2006.

O FC Flora Tallinn Sub19 é uma equipa talentosa com um histórico de sucesso. A equipa tem produzido vários jogadores que passaram a representar a seleção estoniana, incluindo Marko Meerits, Ragnar Klavan e Martin Reim.